Artwork

Innhold levert av Roman Cheplyaka. Alt podcastinnhold, inkludert episoder, grafikk og podcastbeskrivelser, lastes opp og leveres direkte av Roman Cheplyaka eller deres podcastplattformpartner. Hvis du tror at noen bruker det opphavsrettsbeskyttede verket ditt uten din tillatelse, kan du følge prosessen skissert her https://no.player.fm/legal.
Player FM - Podcast-app
Gå frakoblet med Player FM -appen!

#24 Read correction and Bcool with Antoine Limasset

59:44
 
Del
 

Manage episode 215964325 series 1537951
Innhold levert av Roman Cheplyaka. Alt podcastinnhold, inkludert episoder, grafikk og podcastbeskrivelser, lastes opp og leveres direkte av Roman Cheplyaka eller deres podcastplattformpartner. Hvis du tror at noen bruker det opphavsrettsbeskyttede verket ditt uten din tillatelse, kan du følge prosessen skissert her https://no.player.fm/legal.

Antoine Limasset joins me to talk about NGS read correction. Antoine and his colleagues built the read correction tool Bcool based on the de Bruijn graph, and it corrects reads far better than any of the current methods like Bloocoo, Musket, and Lighter.

We discuss why and when read correction is needed, how Bcool works, and why it performs better but slower than k-mer spectrum methods.

Links:

If you enjoyed this episode, please consider supporting the podcast on Patreon.

  continue reading

70 episoder

Artwork
iconDel
 
Manage episode 215964325 series 1537951
Innhold levert av Roman Cheplyaka. Alt podcastinnhold, inkludert episoder, grafikk og podcastbeskrivelser, lastes opp og leveres direkte av Roman Cheplyaka eller deres podcastplattformpartner. Hvis du tror at noen bruker det opphavsrettsbeskyttede verket ditt uten din tillatelse, kan du følge prosessen skissert her https://no.player.fm/legal.

Antoine Limasset joins me to talk about NGS read correction. Antoine and his colleagues built the read correction tool Bcool based on the de Bruijn graph, and it corrects reads far better than any of the current methods like Bloocoo, Musket, and Lighter.

We discuss why and when read correction is needed, how Bcool works, and why it performs better but slower than k-mer spectrum methods.

Links:

If you enjoyed this episode, please consider supporting the podcast on Patreon.

  continue reading

70 episoder

Todos los episodios

×
 
Loading …

Velkommen til Player FM!

Player FM scanner netter for høykvalitets podcaster som du kan nyte nå. Det er den beste podcastappen og fungerer på Android, iPhone og internett. Registrer deg for å synkronisere abonnement på flere enheter.

 

Hurtigreferanseguide

Copyright 2024 | Sitemap | Personvern | Vilkår for bruk | | opphavsrett